诡秘之主讲的什么？
一个现代宅男作死玩了一个类似于“笔仙”的转运仪式，然后就穿越了。他在新的世界里醒过来的时候，发现自己的太阳穴子弹打穿了，但他并没有死而且伤口飞速愈合了起来，只有一个重要的问题，他记不起来自己是被谁打了一枪。
穿越者在这个世界里叫克莱恩，是一个刚刚大学毕业后，正在准备面试的大学生。他的父母都已经去世了，有一个叫梅丽莎的妹妹还在上中学，还有一个喜欢讲段子的哥哥叫班森。一家三口在出租房里过着清贫而幸福的生活。
克莱恩很快就发现，自己的“死而复生”过程里有诡异而神秘的力量。邓恩，一名专门处理神秘事务的“值夜者”告诉他，整件事情都跟他曾经接触过的一本神秘笔记有关系，而这本笔记，正是邓恩所在的黑夜女神教会想要拿到的。
为了更快得到笔记的线索，邓恩邀请克莱恩加入了他所在的值夜者队伍，一开始是试用期，后来喝下魔药，正式成为了一名拥有特异功能的非凡者。此后他和值夜者同事们一起处理了很多起与神秘世界有关的问题和事故，在东奔西走中，克莱恩慢慢成长。
这是故事明面上的主线，除此之外还有几条暗线。主线和暗线交错在一起，所以显得复杂一点。但是只要想清楚了每条暗线的来源，其实不难理解。
第一条暗线，克莱恩穿越之后不久就再一次尝试转运仪式，指望能穿回去，但是并没有如愿，却出现在了一个灰雾弥漫的神秘宫殿里。他发现自己可以随意调动灰雾上的力量，按照自己的心意改变这个空间里的布置。于是他假扮成神灵，自称是“愚者”，骗取了另外两个莫名其妙出现在神秘宫殿里的人信任，和他们一起组建了“塔罗会”。
第二条暗线，克莱恩毕业的大学里有一位名叫阿兹克的老师，其实是一位失忆了的强大非凡者。克莱恩无意中帮助他找回了自己的记忆，于是他的力量也慢慢复苏，后来成为了克莱恩最强的助力。
第三条暗线，在克莱恩穿越过来之前一百年左右，这个世界里还有过另一个我们世界来的穿越者——罗塞尔大帝。他像很多网络小说里的龙傲天主角一样，发明了许多机械，一己之力把世界带进了蒸汽时代，并且建立了属于自己的强大帝国，后来却遭到暗杀，销声匿迹。后来克莱恩发现，罗塞尔留下的日记是用中文简体字书写的，里面藏着许多秘密。
到了故事的最后，作者布设的伏笔线索一条条显现出来，织成了一张大网，故事中的多种“巧合”原来都是被有心人暗中操纵，一场大战之后，“主角”悲壮谢幕，而真正的主角即将登场。